MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL5

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012000	T	6	6	656	661	0 %	100 %	0 %	0 %	222143326
2	NC_012000	TATT	2	8	791	798	25 %	75 %	0 %	0 %	222143326
3	NC_012000	T	6	6	797	802	0 %	100 %	0 %	0 %	222143326
4	NC_012000	TTC	2	6	832	837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143326
5	NC_012000	AAT	2	6	933	938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143326
6	NC_012000	T	6	6	1024	1029	0 %	100 %	0 %	0 %	222143326
7	NC_012000	TAA	2	6	1041	1046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143326
8	NC_012000	A	6	6	1104	1109	100 %	0 %	0 %	0 %	222143326
9	NC_012000	ATA	2	6	1141	1146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143326
10	NC_012000	TCAAAA	2	12	1163	1174	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	222143326
11	NC_012000	AATCT	2	10	1179	1188	40 %	40 %	0 %	20 %	222143326
12	NC_012000	CAT	2	6	1197	1202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143326
13	NC_012000	ATG	2	6	1217	1222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143326
14	NC_012000	TTC	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143326
15	NC_012000	TTA	2	6	1259	1264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143326
16	NC_012000	AT	3	6	1374	1379	50 %	50 %	0 %	0 %	222143326
17	NC_012000	TTA	2	6	1439	1444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143326
18	NC_012000	CAA	2	6	1452	1457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222143326
19	NC_012000	ATA	2	6	1499	1504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143326
20	NC_012000	TTTTCC	2	12	1553	1564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143326
21	NC_012000	TCT	2	6	1586	1591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143326
22	NC_012000	T	6	6	1594	1599	0 %	100 %	0 %	0 %	222143326
23	NC_012000	AAAT	2	8	2204	2211	75 %	25 %	0 %	0 %	222143327
24	NC_012000	TA	3	6	2226	2231	50 %	50 %	0 %	0 %	222143327
25	NC_012000	TGCT	2	8	2291	2298	0 %	50 %	25 %	25 %	222143327
26	NC_012000	TAA	2	6	2382	2387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143327
27	NC_012000	AAT	2	6	2407	2412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143327
28	NC_012000	T	6	6	2423	2428	0 %	100 %	0 %	0 %	222143327
29	NC_012000	GAAT	2	8	2467	2474	50 %	25 %	25 %	0 %	222143327
30	NC_012000	TTC	2	6	2475	2480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143327
31	NC_012000	TCT	2	6	2521	2526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143327
32	NC_012000	T	6	6	2580	2585	0 %	100 %	0 %	0 %	222143327
33	NC_012000	TCC	2	6	2602	2607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222143327
34	NC_012000	GTC	2	6	2608	2613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222143327
35	NC_012000	TC	3	6	2650	2655	0 %	50 %	0 %	50 %	222143327
36	NC_012000	TGT	2	6	2662	2667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222143327
37	NC_012000	AT	4	8	2681	2688	50 %	50 %	0 %	0 %	222143327
38	NC_012000	TTA	2	6	2690	2695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143327
39	NC_012000	TTGTT	2	10	2701	2710	0 %	80 %	20 %	0 %	222143327
40	NC_012000	TTC	2	6	2727	2732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143327
41	NC_012000	TCT	2	6	2744	2749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143327
42	NC_012000	TTC	3	9	2812	2820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143327
43	NC_012000	T	6	6	2905	2910	0 %	100 %	0 %	0 %	222143328
44	NC_012000	TCT	2	6	2912	2917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143328
45	NC_012000	TACGT	2	10	2930	2939	20 %	40 %	20 %	20 %	222143328
46	NC_012000	TTC	2	6	2995	3000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143328
47	NC_012000	TTC	2	6	3025	3030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143328
48	NC_012000	TATC	2	8	3072	3079	25 %	50 %	0 %	25 %	222143328
49	NC_012000	TGTTC	2	10	3081	3090	0 %	60 %	20 %	20 %	222143328
50	NC_012000	TGA	2	6	3112	3117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143328
51	NC_012000	TTC	2	6	3142	3147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143328
52	NC_012000	T	6	6	3167	3172	0 %	100 %	0 %	0 %	222143328
53	NC_012000	GTT	2	6	3183	3188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222143328
54	NC_012000	TTTG	2	8	3190	3197	0 %	75 %	25 %	0 %	222143328
55	NC_012000	TTG	2	6	3206	3211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222143328
56	NC_012000	TAA	3	9	3234	3242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143328
57	NC_012000	TGTGAT	2	12	3243	3254	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	222143328
58	NC_012000	T	7	7	3306	3312	0 %	100 %	0 %	0 %	222143328
59	NC_012000	T	6	6	3474	3479	0 %	100 %	0 %	0 %	222143328
60	NC_012000	TTC	2	6	3490	3495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143328
61	NC_012000	TAAT	2	8	3500	3507	50 %	50 %	0 %	0 %	222143328
62	NC_012000	GTT	2	6	3542	3547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222143328
63	NC_012000	CAT	2	6	3575	3580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143329
64	NC_012000	TCT	2	6	3610	3615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143329
65	NC_012000	TAC	2	6	3674	3679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143329
66	NC_012000	TCAC	2	8	3832	3839	25 %	25 %	0 %	50 %	222143329
67	NC_012000	GTTC	2	8	3923	3930	0 %	50 %	25 %	25 %	222143329

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.